Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9CWU4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9CWU4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms