Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ddx28Q9CWT6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms