Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx10Q9CWT3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx10Q9CWT3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms