Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVR1

Gm26657, Predicted gene, 26657 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26657Q9CVR1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm26657Q9CVR1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm26657Q9CVR1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms