Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rprd1bQ9CSU0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rprd1bQ9CSU0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms