Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
1700029F12RikQ9CRB4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms