Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR35

Ctrb1, Chymotrypsinogen B, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctrb1Q9CR35 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Ctrb1Q9CR35 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ctrb1Q9CR35 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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