Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR25

Dph2, 2-(3-amino-3-carboxypropyl)histidine synthase subunit 2, mousemouse

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Length 489 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dph2Q9CR25 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dph2Q9CR25 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Dph2Q9CR25 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Dph2Q9CR25 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms