Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4931417E11RikQ9CR05 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.7 ms