Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PompQ9CQT5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PompQ9CQT5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms