Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rab5aQ9CQD1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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