Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ska1Q9CPV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms