Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nsmce3Q9CPR8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Nsmce3Q9CPR8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Nsmce3Q9CPR8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nsmce3Q9CPR8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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