Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2ird2Q99NI3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gtf2ird2Q99NI3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms