Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Cep41Q99NF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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