Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Hdac9Q99N13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdac9Q99N13 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms