Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SrrtQ99MR6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrrtQ99MR6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms