Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gtpbp4Q99ME9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gtpbp4Q99ME9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms