Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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