Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psmd6Q99JI4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psmd6Q99JI4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms