Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pacsin3Q99JB8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms