Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan1Q99J59 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms