Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cts3Q91ZD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cts3Q91ZD5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms