Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Synpo2Q91YE8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Synpo2Q91YE8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms