Protein–RNA interactions for Protein: Q8VI47

Abcc2, Canalicular multispecific organic anion transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc2Q8VI47 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Abcc2Q8VI47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Abcc2Q8VI47 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms