Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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Smg8Q8VE18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Smg8Q8VE18 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Smg8Q8VE18 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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