Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Dnajc28Q8VCE1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Dnajc28Q8VCE1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms