Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc12Q8R344 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc12Q8R344 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms