Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CipcQ8R0W1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CipcQ8R0W1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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