Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b4Q8QZY9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms