Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Prpf39Q8K2Z2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms