Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y7

Mrpl47, 39S ribosomal protein L47, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl47Q8K2Y7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mrpl47Q8K2Y7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Mrpl47Q8K2Y7 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms