Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TwnkQ8CIW5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TwnkQ8CIW5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms