Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mterf1aQ8CHZ9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mterf1aQ8CHZ9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms