Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rab11fip3Q8CHD8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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