Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx8Q8CFD4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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