Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Spef2Q8C9J3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Spef2Q8C9J3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms