Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp1Q8C4U3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms