Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Usp47Q8BY87 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Usp47Q8BY87 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
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