Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ss18l1Q8BW22 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms