Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Pggt1bQ8BUY9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pggt1bQ8BUY9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pggt1bQ8BUY9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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