Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vipas39Q8BGQ1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Vipas39Q8BGQ1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vipas39Q8BGQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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