Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG40

Katnb1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, mousemouse

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Katnb1Q8BG40 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Katnb1Q8BG40 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Katnb1Q8BG40 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms