Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFV3

Dusp4, Dual specificity protein phosphatase 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp4Q8BFV3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dusp4Q8BFV3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dusp4Q8BFV3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms