Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT9

Svop, Synaptic vesicle 2-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvopQ8BFT9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SvopQ8BFT9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SvopQ8BFT9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms