Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-M10.3Q85ZW6 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms