Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Acsm4Q80W40 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Acsm4Q80W40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms