Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc29Q80VM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ttc29Q80VM3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ttc29Q80VM3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc29Q80VM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc29Q80VM3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms