Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sgo2Q7TSY8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sgo2Q7TSY8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms