Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Dsg1cQ7TSF0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms